Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHDC9Q8NEP7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHDC9Q8NEP7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHDC9Q8NEP7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHDC9Q8NEP7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHDC9Q8NEP7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLHDC9Q8NEP7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC9Q8NEP7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms