Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF248Q8NDW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF248Q8NDW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF248Q8NDW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms