Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC29Q8NA56 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC29Q8NA56 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms