Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMPERQ8N8U9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMPERQ8N8U9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMPERQ8N8U9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMPERQ8N8U9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms