Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M3

FITM2, Fat storage-inducing transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM2Q8N6M3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FITM2Q8N6M3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FITM2Q8N6M3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FITM2Q8N6M3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FITM2Q8N6M3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FITM2Q8N6M3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FITM2Q8N6M3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FITM2Q8N6M3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FITM2Q8N6M3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FITM2Q8N6M3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FITM2Q8N6M3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms