Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf62Q8N4C0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf62Q8N4C0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C9orf62Q8N4C0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf62Q8N4C0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms