Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MFSD4AQ8N468 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MFSD4AQ8N468 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms