Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
VWDEQ8N2E2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
VWDEQ8N2E2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
VWDEQ8N2E2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
VWDEQ8N2E2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
VWDEQ8N2E2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms