Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT78Q8N1N4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT78Q8N1N4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT78Q8N1N4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT78Q8N1N4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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