Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC22A9Q8IVM8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC22A9Q8IVM8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms