Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSIG1Q86XK7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSIG1Q86XK7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms