Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HAPLN4Q86UW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HAPLN4Q86UW8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HAPLN4Q86UW8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms