Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
NPM2Q86SE8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NPM2Q86SE8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NPM2Q86SE8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms