Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7D3

VTCN1, V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTCN1Q7Z7D3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTCN1Q7Z7D3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTCN1Q7Z7D3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTCN1Q7Z7D3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTCN1Q7Z7D3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTCN1Q7Z7D3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTCN1Q7Z7D3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTCN1Q7Z7D3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTCN1Q7Z7D3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTCN1Q7Z7D3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms