Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP1Q7Z6B7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRGAP1Q7Z6B7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP1Q7Z6B7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms