Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOP2Q7RTS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOP2Q7RTS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.57■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.55■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.54■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.52■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.52■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP2Q7RTS6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP2Q7RTS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP2Q7RTS6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms