Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRADAQ7RTN6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRADAQ7RTN6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRADAQ7RTN6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRADAQ7RTN6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
STRADAQ7RTN6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms