Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDZD4Q76G19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZD4Q76G19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZD4Q76G19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDZD4Q76G19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms