Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWH5

NEK10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK10Q6ZWH5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK10Q6ZWH5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK10Q6ZWH5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK10Q6ZWH5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK10Q6ZWH5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK10Q6ZWH5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK10Q6ZWH5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms