Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BEND4Q6ZU67 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEND4Q6ZU67 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEND4Q6ZU67 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms