Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA0408Q6ZU52 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA0408Q6ZU52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIAA0408Q6ZU52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIAA0408Q6ZU52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms