Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms