Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC73Q6ZRK6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC73Q6ZRK6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC73Q6ZRK6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms