Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEX3BQ6ZN04 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEX3BQ6ZN04 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEX3BQ6ZN04 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms