Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
CD109Q6YHK3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CD109Q6YHK3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CD109Q6YHK3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CD109Q6YHK3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CD109Q6YHK3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms