Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXW12Q6X9E4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXW12Q6X9E4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW12Q6X9E4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXW12Q6X9E4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXW12Q6X9E4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXW12Q6X9E4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXW12Q6X9E4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms