Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAP2EQ6VUC0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAP2EQ6VUC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms