Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL35Q6PF15 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL35Q6PF15 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms