Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF549Q6P9A3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF549Q6P9A3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms