Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEPROQ6NW34 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEPROQ6NW34 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEPROQ6NW34 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms