Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RCSD1Q6JBY9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RCSD1Q6JBY9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCSD1Q6JBY9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms