Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM225Q6GV28 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM225Q6GV28 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM225Q6GV28 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM225Q6GV28 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms