Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A4Q6AI14 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A4Q6AI14 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms