Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1BQ659C4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP1BQ659C4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP1BQ659C4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1BQ659C4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms