Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXM1

CDCP2, CUB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCP2Q5VXM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCP2Q5VXM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCP2Q5VXM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCP2Q5VXM1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCP2Q5VXM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCP2Q5VXM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCP2Q5VXM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCP2Q5VXM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCP2Q5VXM1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCP2Q5VXM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCP2Q5VXM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCP2Q5VXM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCP2Q5VXM1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms