Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GARNL3Q5VVW2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GARNL3Q5VVW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GARNL3Q5VVW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms