Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC01545Q5VT33 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01545Q5VT33 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms