Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CAMSAP1Q5T5Y3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CAMSAP1Q5T5Y3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CAMSAP1Q5T5Y3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CAMSAP1Q5T5Y3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CAMSAP1Q5T5Y3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CAMSAP1Q5T5Y3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CAMSAP1Q5T5Y3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CAMSAP1Q5T5Y3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms