Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHYHD1Q5SRE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1Q5SRE7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHYHD1Q5SRE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHYHD1Q5SRE7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms