Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYAQ5MJ70 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYAQ5MJ70 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPDYAQ5MJ70 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDYAQ5MJ70 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms