Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDKL4Q5MAI5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL4Q5MAI5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL4Q5MAI5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL4Q5MAI5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms