Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF8

PABPC1L2A, Polyadenylate-binding protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1L2AQ5JQF8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms