Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF8

PABPC1L2A, Polyadenylate-binding protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1L2AQ5JQF8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1L2AQ5JQF8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1L2AQ5JQF8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PABPC1L2AQ5JQF8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PABPC1L2AQ5JQF8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.9 ms