Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RTL5Q5HYW3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RTL5Q5HYW3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RTL5Q5HYW3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RTL5Q5HYW3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms