Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM1Q5H8C1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FREM1Q5H8C1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.2 ms