Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMPK2Q5EBM0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CMPK2Q5EBM0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms