Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NOM1Q5C9Z4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOM1Q5C9Z4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NOM1Q5C9Z4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 436.5 ms