Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL12Q53G59 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL12Q53G59 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL12Q53G59 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms