Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9L6

TMEM119, Transmembrane protein 119, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM119Q4V9L6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM119Q4V9L6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM119Q4V9L6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM119Q4V9L6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMEM119Q4V9L6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM119Q4V9L6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms