Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL9Q3SXZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL9Q3SXZ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms