Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C18orf21Q32NC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf21Q32NC0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf21Q32NC0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms